Conţinut

• Tip fișier Aliniament comprimat
• Binar
• Ce este un fișier CRAM?
• Despre fișierele CRAM

Tip fișier Aliniament comprimat

Dezvoltator	EBI
Popularitate	3.0 (1 vot)
Categorie	Fișiere de date
Format	Binar X Binar Acest fișier este salvat într-un format binar, care necesită un anumit program pentru a citi conținutul acestuia.

Ce este un fișier CRAM?

Formatul de fișiere de aliniere comprimat dezvoltat de EBI, un punct de referință al Laboratorului European de Biologie Moleculară; stochează aliniamentele citirii secvențelor scurte de ADN generate de alinierele de citire scurte, cum ar fi BWA, BBMap și BLAT. Mai multe informatii

Formatul de fișier CRAM este similar formatului de fișier aliniament binar / hărți (BAM), dar are o compresie mai bună a fișierelor și un format de container binar orientat pe coloane. Pe măsură ce volumele de date cresc în domeniul software-ului genetic, formatul CRAM a fost conceput pentru a reduce amprenta piciorului de disc al datelor de aliniere.

Sincronizarea citirii scurte este procesul de descifrare a locului în care provine o secvență din genom. Acest lucru poate fi dificil deoarece genomul de referință este destul de mare și nu căutați întotdeauna potriviri exacte în genomul de referință. Cititoarele de citire scurte sunt folosite pentru a căuta secvențe enorme pentru potriviri și potriviri apropiate. Deoarece secvențele sunt atât de mari, comprimarea oferită de formate precum CRAM este necesară pentru a menține dimensiunile fișierelor ușor de gestionat.

FREE DOWNLOAD Obțineți File Viewer pentru programele Android care deschid fișierele CRAM

ferestre

Samtools

Actualizat 1/11/2016

Despre fișierele CRAM

Scopul nostru este de a vă ajuta să înțelegeți ce este un fișier cu un sufix * .cram și cum să îl deschideți.

Tipul de fișier aliniament comprimat, descrierea formatului de fișier și programele Windows listate pe această pagină au fost cercetate individual și verificate de echipa FileInfo. Ne străduim să obținem acuratețe de 100% și să publicăm doar informații despre formatele de fișiere pe care le-am testat și validat.

Dacă doriți să sugerați adăugări sau actualizări la această pagină, vă rugăm să ne anunțați.